טלטלה בצמרת המשטרה: גיבור 7 באוקטובר פורש בצל עימותים עם המפכ"ל

בבוקר 7 באוקטובר 2023 כיהן כהן כמפקד המחוז הדרומי. לאחר שזיהה כי מדובר בחדירת מחבלים נרחבת, הוא הפעיל בשעה 6:41 פקודה מבצעית קריטית לגיוס כוחות. בהמשך הצטרף ללחימה בקו הראשון, כולל בקרב על תחנת המשטרה בשדרות, שם נפצע מרסיס בעינו ושני קליעים בגבו. למרות פציעתו, הוא סירב להתפנות, המשיך לאופקים לטיפול באירוע בני ערובה, ומאוחר יותר הורה על הריסת תחנת המשטרה בשדרות שבה התבצרו מחבלים.

לאחר שירותו בדרום מונה כהן למפקד מחוז המרכז. במהלך כהונתו הוקם מרחב אייל והמחוז רשם ירידות משמעותיות בשיעורי הפשיעה, כולל ירידה של 67% במקרי הרצח. השר לביטחון לאומי איתמר בן-גביר שיבח את כהן כגיבור 7 באוקטובר, פעילות שבגינה נבחר כהן להשיא משואה בטקס יום העצמאות ה-76 של מדינת ישראל.